Jussi Niinistöt kannustas ülikooliõpinguteks, väitekirja kirjutamiseks ja teadustööks akadeemiline vabadus. Teadustöö jäi aga kõrvale, kui tal avanes võimalus osaleda poliitikas. Niinistö jälgib praegugi Soome ajaloouurimuse suundi. Lõõgastudes meeldib Niinistöle kuulata oma vanaaegsest raadiost soovilugude saadet „Lauantain toivotut levyt“.