Ote Rainer Knapaksen kirjallisesta tuotannosta:

• Pyhtään kirkko  = Pyttis kyrka, 1969.
• Ruotsinsalmi – Kyminlinna. Fästningsbyggnadskonst och militärsamhälle 1791–1810, 1970.
• Lappeenrannan linnoitus. Rakennushistoria ja säilyneet rakennukset. Alustava selvitys, 1976.
• Industrialisering och urbanisering i sydöstra Finland, toimittaja, 1977.
• Jordbrukets mekanisering i Vasatrakten 1870–1890. En innovationsstudie med exempel från Petalax kommun, 1977.
• Suomen kansallisoopperan talo = Finlands nationalopera operahuset = The Finnish National Opera house, yksi kirjoittajista, 1979.
• Militärarkitekturen i Gamla Finland 1743–1808, 1981.
• Ur armod och ur ödemark, toimittaja, 1982.
• Ars universitaria, 1640–1990. Arkitekturritningar och möbler ur Helsingfors universitets samlingar, yksi kirjoittajista, 1990.
• Universitas Helsingensis 350. Past and present 1640–1990, toimittaja, 1990.
• Självständighetens metaforer – Finland 1917–1918, 1992.
• Historiallisia kuvia. Suomi vanhassa grafiikassa, yksi kirjoittajista, 1993.
• Boken om vårt land 1996. Festskrift till professor Matti Klinge, toimittaja, 1996.
• Resan till Italien. Gustaf Mauritz Armfelts resedagbok 1783–1784, redaktör, 1997.
• Matti Klinge et al., Helsingin Yliopisto 1640-1990, I-III, yksi kirjoittajista sekä toimittja, myös ruotsiksi: Helsingfors Universitet 1640-1990, I-III, 1998-1991.
• Finlands svenska litteraturhistoria I-II, 1999-2000, yksi kirjoittajista sekä toimittaja osassa I, kuvatoimittja osissa I-II.
• Suomen kulttuurihistoria 2. Tunne ja tieto. Julkaistu yhdessä Nils Erik Forsgårdin kanssa, 2002.
• Vandraren. Reseberättelser från Karelen 1828–1842. Elias Lönnrot, Rainer Knapaksen julkaisemina, 2002.
• Monrepos. Ludwig Heinrich Nicolay och hans värld i 1700-talets ryska Finland, 2003.
• Albert Edelfelt och Ryssland. Brev från åren 1875-1905, julkaistu yhdessä Maria Vainion kanssa, 2004.
• Idyll och hjältemod. J. L. Runeberg i bokkonsten, 2004.
• Monrepos. Ranskalaisen kulttuurin pohjoinen keidas, 2008, myös ranskaksi: Monrepos. Un Arcadie des Lumières, 2008.
• Zacharias Topelius, Finland framställdt i teckningar, julkaistu yhdessä Jens Grandellin kanssa, 2011.
• Kunskapens rike. Helsingfors universitetsbibliotek – Nationalbiblioteket 1640-2010, 2012, myös suomeksi: Tiedon valtakunnassa. Helsingin yliopiston kirjasto – Kansalliskirjasto 1640-2010.

Näiden lisäksi muun muassa

• Artikkeleita ja arvosteluja aikakauslehdessä Historisk Tidskrift för Finland
• Kolumneja aikakauslehdessä Ny Tid