Helsingin yliopistomuseo vastaa yliopiston kansallisesti arvokkaista kulttuurihistoriallisista kokoelmista. Vain pieni osa 55 000 esineestä on esillä näyttelyissä tai muissa yliopiston tiloissa. Yliopiston taidekokoelma, noin 1 200 teosta, on kuitenkin esillä lähes kokonaan. Valtaosa kokoelmista on sijoitettu varastoihin.

Viime vuosien suurprojekti on ollut kokoelmien siirto museaaliset vaatimukset täyttäviin uusiin kokoelmatiloihin. Pääkokoelmatilan siirtoprojekti loppuu vuonna 2015, mutta muutettavaa riittää vielä vuosiksi senkin jälkeen. Valittuihin osiin kokoelmista voi tutustua Arjenhistoria.fi-kokoelmaportaalissa.